Инфекционные заболевания вызваны патогенными микроорганизмами, такими как бактерии и вирусы. Домашние кролики особенно подвержены влиянию данных болезней: инфекционного фиброматоза, папилломатоза, кроличьей оспы, миксоматоза, герпесвирусной инфекции и ротавирусного энтерита.